水厂可以选择的碳源很多。例如：乙酸钠、葡萄糖、乙酸、复合碳源等等。但不同碳源的分子结构不同，微生物的吸收和利用效果就不同。此外，我们需要配合水厂的处理工艺，选择与系统匹配的碳源，并按照正确的方式使用。这决定了生化系统能否迅速进入有利于脱氮菌种发挥作用的环境，达到高效去除，成本最优，持续稳定达标的出水目标。
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复合碳源药剂在应用时主要用于城市污水、工业废水的处理。在废水处理时根据药剂性质和水体污染程度将原液稀释到相应浓度后投加，对于污染严重的废水可选择原药直接投加的方式。
复合碳源药剂是一种、高效、快速、低耗、无毒的小分子碳源补充剂，兼具几种外加碳源药剂的优点，化学性质稳定，反硝化速率快，污泥产量低，污泥菌种适应快，脱氮效果好，处理成本低于其他几种常规碳源药剂，适用于污水厂的应急投加处理，满足水质排放要求的同时达到最大经济效果，是一种稳定的低成本碳源补充剂。
生物脱氮需要完成硝化和反硝化两个过程。废水中的氨氮首先必须被硝化或转化成亚硝酸盐和硝酸盐，然后在反硝化过程中，硝酸盐被作为细胞呼吸过程中氧化简单碳化合物的供养体被还原成氮气。因此，以去除硝酸盐为目标的反硝化过程必须要有易生物降解的碳源存在。其来源包括进水中溶解性BOD、内源反硝化过程中细胞的糜烂物和各类上清液回流等。当进水溶解性有机物不足而脱氮要求很高时，则需要通过补充化学物质以提供反硝化过程所需要的碳源。