碳源提供细胞组分或代谢产物种碳素来源的各种营养物质称为碳源。
提供细胞组分中氮素来源的各种物质称为氮源。营养元素碳氮的比例关系称为碳氮比。微生物常用的碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。有机碳源包括各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等。无机碳源主要是CO2（CO32－或 HCO-3）。氮源也可分为两类：有机氮源（如蛋白质、蛋白胨、氨基酸等）和无机氮源（如NH4Cl、NH4NO3等）。
用于污水处理的碳源有甲醛、乙酸、葡萄糖、面粉等简单有机物，但是这些东西都有相应的缺陷，且价格不低。东莞环洁化工污水处理碳源，小分子碳源用于污水处理，综合比较理想。