1、没有分析原水中的有机氮成分
解决办法：分析原水水质；设置有机氮转化工艺（如厌氧、水解等工艺）
2、硝化反硝化
2.1、原水碳源不足且未投加额外碳源，导致反硝化进行时碳源不足，难以彻底脱除总氮
解决办法：精确计算碳源投加量；确定碳源品种。
2.2、硝化液回流比过大，导致反硝化池内溶解氧过高，难以反硝化
解决办法：调整回流比；优化硝化池结构做法；设置消氧区。
2.3、硝化反硝化池容积计算
解决办法：精确计算硝化反硝化池容积。
2.4、硝化池风量核算没有考虑氨氮的需氧量导致氨氮无法转化成硝态氮
解决办法：精确计算氨氮生物氧化需氧量。
2.5、硝化池泡沫过多
解决办法：设置消泡装置或者喷淋装置。
2.6、温度影响反硝化的进行
解决办法：设置保温。
2.7、污泥龄的问题
解决办法：调整排泥量。
2.8、硝化池PH问题。
解决办法：设置PH投加装置；自动控制硝化池内的PH值。
废水中含有机氮；含有机氮废水大多具有难降解、高氮低碳、 成分复杂等特点。
这些废水中的有机氮能否有效分解直接影响整个系统对于总氮的处理效果，所以废水中有机氮的降解及其降解所产生的氨氮的去除是这类废水处理的重点和难点。