市政污水处理厂进水管网中TN的含量相对稳定，但如果接纳工业废水，由于缺乏调节池的环节，可能会出现进水TN的指标波动，在系统进水流量不变的情况下，需要及时控制碳源投加量的大小。
由于化验室TN检测时间较长，无法满足及时调整的要求，可以采用在线监测的手段，将TN、COD、NH3-N等数据传输给控制系统，系统经过计算自动调整碳源加药泵的流量或调节阀开度，实现碳源自动投加控制。
碳源投加点应在反硝化池前端进行，必须实现投药与进水及回流液充分混合。混合后在阶段曝气和潜水搅拌机的作用下，与反硝化污泥继续充分混合。只有碳源、污水和污泥充分混合的情况下，才能保证反硝化细菌与污染物质充分接触并进行足够时间的反硝化作用，达到最佳的处理效果。
投加点可以设置在进水管道上，也可以设置在反硝化池进水端口，需要注意的是尽量避免短流，并保证反硝化池的充分搅拌。搅拌不应过度，过大的水力搅拌强度会造成水力切削和污泥过度碰撞，造成污泥絮体的物理性解体，并且造成碳源难以吸附在污泥表面上，影响反硝化效率。
碳源的投加以粗放式和精确式进行，碳源补充应尽量以液态方式进行。条件不满足的情况下，可以根据技术人员的经验，以固态碳源的形式，称重后撒入反硝化池前端。该方式误差较大，并应考虑固态碳源入水后的溶解和水解、电离等过程的时间问题。
条件满足的情况下，应尽量以溶液形式投加碳源，并做好计量或自动控制。碳源溶液的浓度以高量、较低浓度为宜。
投加前还应注意药品的预处理，加药泵前过滤，药品质量控制等问题。
碳源在反硝化系统中的投加不能太过超量，否则会影响反硝化池中的微生物菌种优势。太过量的BOD会造成在缺氧条件下，出现过多的厌氧细菌。也会出现较多的好氧细菌，消耗BOD和溶解氧。从而导致好氧细菌、厌氧细菌与反硝化细菌菌群的竞争关系，影响反硝化处理效果。