污水处理厂在选择外加碳源的时候应综合考虑安全性、经济性及反硝化速率。水处理碳源的运输和储存应规避易燃易爆的风险，安全生产已是各企业不可忽视的重要制度。不同的水处理碳源配方在同样一个反硝化工艺上会表现出不同的碳氮比、不同的微生物增长速度、不同的反硝化速率等。因此我们在水处理碳源配方的设计在前置反硝化和后置反硝化会有区别。前置反硝化更加注重低碳氮比、微生物适量增长、反硝化速率适当的产品。后置反硝化滤池更加注重低碳氮比、微生物增长慢、反硝化速率快的产品。
维持微生物所需要的能量。污水处理菌种生化调试培养需要投加碳源、氮源、磷源，微生物在生化池中繁殖需要大量的能量，在培养过程中污水的进出水口需要关闭几天，没有污水流进，没有补充营养源，微生物在繁殖没有食物饮食，从而导致死亡。
在调试培养微生物碳源严重不足会影响生化过程，脱氮除磷能力与效率主要因素。目前城市污水处理厂排放标准日趋严格，对于出水的氨氮、总磷、总氮等指标都有严格的要求，提标改造过程中，总氮的控制比其它指标更为困难。