在城市污水处理厂的实际运行中，优选碳源时应注意以下几点：(1)深入了解不同碳源的特性，结合具体的进水水质特点，选择最佳碳源，具体问题具体分析，切忌照搬;(2)可开发利用的碳源种类很多，但考虑到污水处理厂的运行成本，并注意选择可操控性强的碳源，做到经济性和高效性的统一;(3)根据不同碳源的不同性质，还可考虑同时利用多种碳源，做到内、外碳源有机结合，以达到最佳脱氮除磷效果;(4)进一步优化城市污水处理厂的处理工艺和运行参数，提高运行管理水平，最大限度提高整个流程的处理效率。
污水处理的厌氧池，缺氧池和好氧池在日常运行中为了补充碳源，选择外加碳源，现在如今常用的碳源包括甲醇、乙醇、乙酸、乙酸钠等液态有机物及糖类;(2)其他类型的碳源，如工业废水、垃圾渗滤液。
一般加在厌氧和好氧系统里。就厌氧而言，主要考虑因素为酸化程度，进水COD，反应在指标上即PH,VFA，COD。COD一般不用考虑，这在均质池(综合调节池)就可以调节的。要根据进水水质情况来决定加多少。一般是加在进生化池前，用水溶解后加入。好氧而言，在不缺少BOD的情况下是不需要加的，缺少的话就要加了，因为缺少BOD的情况下，容易会产生硝化。
为了提供碳源，这是为了更好的培养细菌，提高污水的可生化性。污水处理中作为污泥营养源，若运行的系统中COD、BOD不足以供给菌种生长繁殖的话，就需要另外投加，以防污泥老化，生物活性降低。
主要用于生产废水的脱氮除磷，在用以提高城市污水处理厂的脱氮除磷效率的应用环节上有待进一步的探讨。