添加碳源的目的是除氮，但考虑到脱氮效果，也要兼顾污水处理厂的稳定运行，避免处理成本的增加。
1、污泥产量。
首先，添加碳源肯定会增加污泥产量，而且污泥处理成本很高。在常用的碳源中，乙酸和乙酸钠价格昂贵，污泥产量高，会给污水处理厂的污泥处置带来一定的压力。以葡萄糖为代表的糖作为外部碳源，使 得脱氮效果良好。然而，糖作为一种多分子化合物，容易引起大量细菌，导致污泥膨胀。
2、出水COD值和亚硝基氮积累
次之，一些碳源的加入也会影响出水COD值和亚硝基氮积累。以糖为碳源会增加出水COD值，影响出水水 质。同时，与酒精碳源相比，更容易产生亚硝酸盐氮积累。甲醇作为外部碳源，具有运行成本低、污泥 产率低的优点，但当甲醇的碳源不足时，会出现亚硝酸盐积累的现象。另外，如果投加量控制不好，或 者系统进水变化波动太大，很容易造成生化系统中毒，好氧区丝状菌膨胀。
复合碳源推荐
生物利用率高，促进反硝化脱氮异养菌群的快速繁殖；
有效COD含量高，针对反硝化细菌专一定制，性价比普遍优于甲醇、乙醇、淀粉、葡萄糖、乙酸及乙酸钠 等传统碳源；