碳源提供细胞组分或代谢产物种碳素来源的各种营养物质称为碳源。
提供细胞组分中氮素来源的各种物质称为氮源。营养元素碳氮的比例关系称为碳氮比。微生物常用的碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。有机碳源包括各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等。无机碳源主要是CO2（CO32－或 HCO-3）。氮源也可分为两类：有机氮源（如蛋白质、蛋白胨、氨基酸等）和无机氮源（如NH4Cl、NH4NO3等）。
废水生物处理方法有：
污水处理厂都是生物化法处理污水，生物化学法指通过微生物处理含重金属废水，将可溶性离子转化为不溶性化合物而去除。硫酸盐生物还原法是一种典型生物化学法。该法是在厌氧条件下硫酸盐还原菌通过异化的硫酸盐还原作用，将硫酸盐还原成H2S，废水中的重金属离子可以和所产生的H2S反应生成溶解度很低的金属硫化物沉淀而被去除，同时H2SO4的还原作用可将SO42-转化为S2-而使废水的pH值升高。
用于污水处理的碳源有甲醛、乙酸、乙酸钠、葡萄糖、面粉等简单有机物，但是这些东西都有相应的缺陷，且价格不低。要选择水处理碳源，小分子碳源用于污水处理，综合比较理想。
最近两年环洁化工推广新型复合碳源，以多种有机物质为原料，经过发酵和特种酶水解技术生产的一种新型碳源产品。并且复合碳源具有少量投加，易被微生物吸收利用，减少有机污泥产量，提高污泥活性的特点。它是污水生化系统启动调试或缩短恢复时间的必备碳源产品，同时也是传统脱氮、氯酸盐去除工艺的碳源首选。