碳源不足导致生化处理单元的脱氮除磷效果不能达到理想状态，从而影响出水水质的稳定。生物脱氮，是反硝化细菌利用亚硝化细菌和硝化细菌联合作用生成的硝酸盐混合液，在缺氧条件下分解碳源产生的能量，将硝酸盐转换成氮气；生物除磷，是聚磷菌在厌氧条件下分解进水中的碳源等营养物质合成自身的能量同时释放体内的磷，再在好氧条件下利用合成的能量超量吸收磷，通过排除剩余污泥，达到除磷的效果。生物脱氮除磷过程中都需要使用碳源等营养物质实现能量的生成，而进水碳源的不足，将影响脱氮除磷最佳效果的实现。所以在整个污水处理厂净化处理中，碳源的选择和投加对于整个污水处理厂净化处理效果提升是很有必要的，只有保障了碳源选择正确和有效投加，才能将整体的污水处理净化效果提升。
碳源投加选择
常用的外加碳源有甲醇、乙酸、酒业废水、乙酸盐、淀粉、葡萄糖和醋酸钠等。2020年开始常用的外加碳源的被复合碳源代替。
不同的外加碳源在反应性能以及反应条件的应用上都存在差别，要想保障整体的碳源投加效果，应选择合适的碳源，确定高效且经济合理的投加量。
碳源的选择对于整个污水处理厂净化效果提升具有重要影响。通过对进水水质的检测，了解进水中碳源等有机物的含量，从而分析进水碳源对生物脱氮除磷的基本影响，为后续碳源的投加提供初步参考。