复合碳源药剂在应用时主要用于城市污水、工业废水的处理。在废水处理时根据药剂性质和水体污染程度将原液稀释到相应浓度后投加，对于污染严重的废水可选择原药直接投加的方式。投加剂量主要由水体污染程度、投加点和小试情况决定，通常为每升废水投加100～350mg(废水污染程度以总氮指标来衡量)。
复合碳源药剂是一种、高效、快速、低耗、无毒的小分子碳源补充剂，兼具几种外加碳源药剂的优点，化学性质稳定，反硝化速率快，污泥产量低，污泥菌种适应快，脱氮效果好，处理成本低于其他几种常规碳源药剂，适用于污水厂的应急投加处理，满足水质排放要求的同时达到最大经济效果，是一种稳定的低成本碳源补充剂。
生物脱氮需要完成硝化和反硝化两个过程。废水中的氨氮首先必须被硝化或转化成亚硝酸盐和硝酸盐，然后在反硝化过程中，硝酸盐被作为细胞呼吸过程中氧化简单碳化合物的供养体被还原成氮气。因此，以去除硝酸盐为目标的反硝化过程必须要有易生物降解的碳源存在。其来源包括进水中溶解性BOD、内源反硝化过程中细胞的糜烂物和各类上清液回流等。当进水溶解性有机物不足而脱氮要求很高时，则需要通过补充化学物质以提供反硝化过程所需要的碳源。
投加点的选择跟药剂性质、水力条件、水质污染程度有关：
1、本发明最佳的投药点一般选择在缺氧段，效果最佳，药耗最省，同时对水质产生的影响最低;
2、水力条件：混合时水力强度要大，时间要短，保证药剂与水充分混合;
3、水质污染程度较高较难处理时，由于该药剂为中性，对水质波动抗冲击性强，不影响出水水质，可不断增加投加量，确保出水达标排放。