城市污水处理厂普遍存在着反硝化碳源不足的问题，这一问题已经成为了制约生物脱氮效率的重要因素。解决碳源不足的问题，通常有利用内部碳源和投加外部碳源两种办法。在进行污水处理厂外加碳源设计或选择时，不仅要考虑其经济成本和效益，同时也要兼顾碳源本身的安全性，以及生物池内的实际有效停留时间等因素。
碳源不足的解决办法
1、反应池进水不全部进入厌氧区，而是部分进入缺氧区，以保证缺氧区反硝化有充足碳源；
2、二沉池部分回流污泥进入反应池的缺氧区，为反硝化补充碳源；
3、采用食品厂、造纸厂等某些高浓度有机废水作为外加碳源等措施；
4、直接投加外部碳源。
外加碳源的选择原则
1、外加碳源应易被微生物降解，易被反硝化菌利用，不存在残留物对后续出水达标造成不利影响的问题；
2、反应速度足够快，确保所投加的碳源尽量在厌、缺氧功能区内耗尽，避免增加后续曝气系统的负担和运行成本；
3、不会对系统内的微生物种群类型和含量造成影响，避免投加碳源前后出现微生物的短暂适应性问题；
4、价格便宜，安全性好，且易于投加、保存和运输，可就近获得。