碳源的重要性
碳是藻类十分重要的营养元素，在养殖过程中因为缺碳而导致藻类生长不起来的原因相信大家也能明白，前期肥水，施了很多肥，氨氮很高了水还是清澈见底；养殖中后期，越是晴天越容易“倒藻”，泡沫多、藻类老化、氨氮或亚硝酸盐高，这些现象多与水体碳源不足有关。
养殖水体中的碳源是否充足与总碱度中的碳酸根和碳酸氢根离子密切相关。如果养殖过程中只是简单的测量总碱度，而不分析其离子和分子组成（总碱度是指能结合氢离子的离子和分子的总和），即使总碱度很高同样也可能出现缺碳“倒藻”。例如海水的高位池养殖，天然海水一般总碱度较高，但中后期同样出现藻类老化；每天换水，亚硝酸盐高。这里也涉及到总硬度和排污带走了碳源的原因。
藻类光合作用时需要二氧化碳参与，二氧化碳由水体中的碳酸氢根离子与氢离子反应生成。一部分碳酸氢根离子变成碳酸根离子与钙离子结合为碳酸钙沉淀，所以pH值升高、水体出现白浊，在高位池养殖排污时会带走碳酸钙。
池塘补充醋酸钠碳源的原理
通过向养殖水体中添加有机碳源，提高水体中的碳氮比（C/N），促使异养细菌数量大量增长，水体中氨氮及其它无机氮被异养细菌同化生成自身菌体蛋白物质。水体中细菌菌落、浮游动植物和悬浮颗粒物等通过生物絮凝作用形成可被鱼类摄食的生物絮凝体。絮体中大量的异养细菌可同化吸收水体中无机氮，残饵粪便的剩余营养素可得到重复利用，既可净化养殖水体，又能提高饲料蛋白质利用率。
当水体 C/N值很小时，无机氮素的消除主要依赖水体中藻类和一些自养微生物等来清除；当C/N 值在 8-10时，水体主要依赖自养微生物和异养微生物之间相互协同的作用来完成清除过程；当在水体中添加大量碳源提离其C/N 值达到 15以上时，系统则主要依赖异养微生物来清除养殖水体中大量的无机氮。当 C/N达 17.57 时，可以促进微生物合成菌体蛋白，并有效降低养殖水体氨态氮和亚硝态氮。
据研究，1克氮转化为蛋白质至少需要5.25克左右的碳水化合物，而在实际生产中随着养殖高峰期到来，饵料投喂量大幅增加，即氮越来越多，而碳则相对不足，特别是在阴雨天气，光合作用差，补充碳源能有效促进反硝化菌将池水中亚硝酸盐转化为无毒的氮气，降低氨氮、亚硝酸盐的含量，是养殖中后期藻菌调控的关键之一。