用于污水处理的碳源一般包括甲醇、醋酸钠、面粉、葡萄糖和复合碳源等有机物。
人们普遍认为乙醇作为外部碳源具有运行成本低、污泥产量小的优点。当甲醇的碳源不足时，会积累亚硝酸盐。甲醇作为碳源的反硝化速率是葡萄糖作为碳源的3倍，最适碳氮比(化学需氧量氨氮)为2.8~3.2。
醋酸钠
乙酸钠的优势在于其对整个脱氮过程的即时反应，可作为水厂运行中的应急处理。
乙酸钠就是这种小分子水柠檬酸。反硝化菌使用方便，反硝化的实际效果最好。但是由于价格比较高，污泥产量高，污水处理厂的污泥处置问题是目前科技攻关的一大难点，所以在污水处理厂大规模加药应用醋酸钠基本不是这样。
糖类
糖原类化学物质中，小麦粉、绵白糖、果糖占优势。因为果糖是一种很简单的糖，目前有很多科学研究。当碳源充足时，以葡萄糖为碳源的最佳碳氮比高于以甲醇为碳源的最佳碳氮比，范围为6:1 ~ 7:1。碳源类型对硝酸盐和氮的比回收率基本没有危害，但对亚硝酸盐和氮的比积累速率有很大的危害。只有果糖在这次科研中没有发现积累。
使用果糖作为附加碳源的实际效果非常好。然而，由于这种多分子结构的化学物质，很容易引起大量细菌的繁殖，引起污泥膨胀，增加出水的化学需氧量值，危及出水水体。同时，与醛类碳源相比，糖原类化学物质更容易引起亚硝酸盐氮积累。
污泥水解上清液
生物转化VFA来自污泥水解反应的上清液。由于水解反应产生的VFA具有较高的反硝化速率，因此碳源可以在污水处理厂即时显示出来，减少污泥体积时的碳源输送问题。所以是目前比较有利的碳源。
碳源的选择
理论上，各种碳源都能保证出水总氮达到排放标准，但要考虑很多因素：
1.投加碳源的成本
成本是碳源当量COD价格的综合算法，需要理论计算和实际操作来确定成本；
2.碳源污泥产率
添加碳源肯定会增加污泥产量，污泥处理成本很高，是选择碳源时必须考虑的重要项目；
3.保证污水运行的稳定性
加碳源的目的是除氮。因此，在选择碳源时，应注意污水处理厂的稳定运行，如尽可能避免污泥膨胀、提高出水化学需氧量和积累亚硝基氮。
根据以上内容，碳源的选择不是简单的经济核算，而是紧密结合实际稳定运行。科学选择碳源可以有效降低运行成本，保证污水处理厂稳定运行。