投加碳源，必定会增加污泥的产量，而污泥处理成本很高，这个是选择碳源必须考虑到的重要一项。
投加碳源目的是为了脱氮，因此在选择碳源的时候，要兼顾污水处理厂的运行稳定，如尽可能的避免污泥膨胀、出水COD升高、亚硝基氮累积等。
随着污水脱氮要求的提高，新兴起专业生产碳源的企业，他们通过生物工程原理，对一些糖类、农产品废料等进行发酵，生产无毒无害的生物制品，主要组分是小分子有机酸、醇类、糖类。
复合碳源碳营养素是一种以多种矿物质为原料，通过发酵和特殊的酶水解技术生产的高效碳源营养素。它是一种碳营养产品，旨在改善废水处理厂中的总氮，可以用作市政和工业废水处理厂中常规碳源产品的替代品，以提高污泥活性，它也可以有效地改善传统的大剂量碳源产品。